Ada pernghapusan kereta api seperti Sarangan Ekspres, Cepu Ekspres, Singosari Ekspres, perpanjangan rute KA Mutsel sampai Malang dan lain sebagainya.
Diharapkan dengan perubahan jadwal kereta api ini lebih memberikan manfaat dan layanan terbaik kepada pernumpang.
Jadwal Kereta Api April 2017
| NO KA | NAMA KERETA | RUTE | BERANGKAT |
| 1 | Argo Bromo Anggrek | Surabaya - Jakarta | 08.00 |
| 2 | Argo Bromo Anggrek | Jakarta - Surabaya | 09.30 |
| 3 | Argo Bromo Anggrek | Surabaya - Jakarta | 20.00 |
| 4 | Argo Bromo Anggrek | Jakarta - Surabaya | 21.30 |
| 5 | Argo Wilis | Surabaya - Bandung | 07.00 |
| 6 | Argo Wilis | Bandung - Surabaya | 08.30 |
| 7 | Argo Lawu | Solo -Jakarta | 08.00 |
| 8 | Argo Lawu | Jakarta - Solo | 20.15 |
| 9 | Argo Dwipangga | Solo -Jakarta | 20.00 |
| 10 | Argo Dwipangga | Jakarta - Solo | 08.00 |
| 11 | Argo Sindoro | Semaang - Jakarta | 06.00 |
| 12 | Argo Sindoro | Jakarta - Semarang | 16.15 |
| 13 | Argo Muria | Semaang - Jakarta | 16.00 |
| 14 | Argo Muria | Jakarta - Semarang | 07.00 |
| 15 | Argo Jati | Cirebon- Jakarta | 05.25 |
| 16 | Argo Jati | Cirebon- Jakarta | 09.00 |
| 17 | Argo Jati | Cirebon- Jakarta | 13.50 |
| 18 | Argo Jati | Cirebon- Jakarta | 17.20 |
| 19 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 05.00 |
| 20 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 05.05 |
| 21 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 06.30 |
| 22 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 08.45 |
| 23 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 11.35 |
| 24 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 10.30 |
| 25 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 14.45 |
| 26 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 15.30 |
| 27 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 16.10 |
| 28 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 18.45 |
| 29 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 19.40 |
| 30 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 20.00 |
| 31 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 07.35 |
| 32 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 11.30 |
| 33 | Argo Parahyangan | Bandung - Jakarta | 08.35 |
| 34 | Argo Parahyangan | Jakarta - Bandung | 12.35 |
| 7F | Argo Lawu Fakultatif | Solo - Jakarta | 09.00 |
| 8F | Argo Lawu Fakultatif | Jakarta - Solo | 21.15 |
| 9F | Argo Dwipangga Fakultatif | Solo - Jakarta | 21.30 |
| 10F | Argo Dwipangga Fakultatif | Jakarta - Solo | 10.00 |
| 35F | Argo Parahyangan Fakultatif | Bandung - Jakarta | 20.55 |
| 36F | Argo Parahyangan Fakultatif | Jakarta - Bandung | 00.45 |
| 37F | Argo Parahyangan Fakultatif | Bandung - Jakarta | 07.09 |
| 38F | Argo Parahyangan Fakultatif | Jakarta - Bandung | 11.04 |
| 39F | Argo Jati Fakultatif | Cirebon - Jakarta | 14.00 |
| 40F | Argo Jati Fakultatif | Jakarta - Cirebon | 10.12 |
| 41 | Gajayana | Malang - Jakarta | 13.30 |
| 42 | Gajayana | Jakarta -Malang | 17.40 |
| 46-43 | Bima | Malang - Jakarta | 14.25 |
| 44-45 | Bima | Jakarta -Malang | 16.30 |
| 47 | Sembrani | Surabaya - Jakarta | 17.50 |
| 48 | Sembrani | Jakarta -Surabaya | 19.15 |
| 49 | Turangga | Surabaya - Bandung | 16.30 |
| 50 | Turangga | Bandung - Surabaya | 19.30 |
| 51 | Taksaka | Yogyakarta - Jakarta | 08.00 |
| 52 | Taksaka | Jakarta -Yogyakarta | 08.30 |
| 52 | Taksaka | Yogyakarta - Jakarta | 20.00 |
| 54 | Taksaka | Jakarta -Yogyakarta | 20.45 |
| 55 | Bangunkarta | Surabaya - Jakarta | 16.00 |
| 56 | Bangunkarta | Jakarta -Surabaya | 15.00 |
| 60-57 | Purwojaya | Cilacap - Jakarta | 14.30 |
| 58-59 | Purwojaya | Jakarta - Cilacap | 22.06 |
| 61 | Tegal Bahari | Tegal - Jakarta | 05.40 |
| 62 | Tegal Bahari | Jakarta - Tegal | 09.40 |
| 63 | Tegal Bahari | Tegal - Jakarta | 14.50 |
| 64 | Tegal Bahari | Jakarta - Tegal | 11.00 |
| 65 | Tegal Bahari | Tegal - Jakarta | 17.00 |
| 66 | Tegal Bahari | Jakarta - Tegal | 19.45 |
| 67 | Cirebon Ekspres | Cirebon - Jakarta | 05.50 |
| 68 | Cirebon Ekspres | Jakarta - Cirebon | 12.10 |
| 69 | Cirebon Ekspres | Cirebon - Jakarta | 08.30 |
| 70 | Cirebon Ekspres | Jakarta - Cirebon | 22.30 |
| 71F | Cirebon Ekspres Fakultatif | Cirebon - Jakarta | 16.45 |
| 72F | Cirebon Ekspres Fakultatif | Jakarta - Cirebon | 20.30 |
| 73-76 | Harina | Surabaya - Bandung | 16.30 |
| 75-74 | Harina | Bandung - Surabaya | 21.25 |
| 77 | Gumarang | Surabaya - Jakarta | 15.30 |
| 78 | Gumarang | Jakarta -Surabaya | 15.45 |
| 79 | Lodaya | Solo - Bandung | 07.10 |
| 80 | Lodaya | Bandung - Solo | 07.20 |
| 81 | Lodaya | Solo - Bandung | 19.10 |
| 82 | Lodaya | Bandung - Solo | 18.55 |
| 83 | Sancaka | Surabaya - Yogyakarta | 07.30 |
| 84 | Sancaka | Yogyakarta - Surabaya | 06.45 |
| 85 | Sancaka | Surabaya - Yogyakarta | 17.25 |
| 86 | Sancaka | Yogyakarta - Surabaya | 16.40 |
| 87 | Mutiara Timur Siang | Surabaya - Banyuwangi | 09.00 |
| 88 | Mutiara Timur Siang | Banyuwangi - Surabaya | 09.00 |
| 89 | Mutiara Timur Malam | Surabaya - Banyuwangi | 22.00 |
| 90 | Mutiara Timur Malam | Banyuwangi - Surabaya | 22.00 |
| 91 | Malabar | Malang - Bandung | 16.00 |
| 92 | Malabar | Bandung - Malang | 15.45 |
| 93 | Malioboro Ekspres | Malang - Yogyakarta | 08.20 |
| 94 | Malioboro Ekspres | Yogyakarta - Malang | 07.45 |
| 95 | Malioboro Ekspres | Malang - Yogyakarta | 20.10 |
| 96 | Malioboro Ekspres | Yogyakarta - Malang | 20.45 |
| 97-100 | Ciremai Ekspres | Semarang - Bandung | 17.35 |
| 99-98 | Ciremai Ekspres | Bandung - Semarang | 06.15 |
| 102-103 | Ranggajati | Cirebon - Jember | 05.00 |
| 104-101 | Ranggajati | Jember - Cirebon | 05.00 |
| 112-113 | Mutiara Selatan | Bandung - Malang | 16.50 |
| 114-111 | Mutiara Selatan | Malang - Bandung | 16.30 |
| 115 | Senja Utama Solo | Solo - Jakarta | 17.30 |
| 116 | Senja Utama Solo | Jakarta - Solo | 22.00 |
| 117 | Fajar Utama Yogyakarta | Yogyakarta - Jakarta | 07.00 |
| 118 | Fajar Utama Yogyakarta | Jakarta - Yogyakarta | 06.15 |
| 119 | Senja Utama Yogyakarta | Yogyakarta - Jakarta | 17.45 |
| 120 | Senja Utama Yogyakarta | Jakarta - Yogyakarta | 19.00 |
| 121 | Sawunggalih | Kutoarjo - Jakarta | 07.00 |
| 122 | Sawunggalih | Kutoarjo - Jakarta | 08.15 |
| 123 | Sawunggalih | Kutoarjo - Jakarta | 19.00 |
| 124 | Sawunggalih | Kutoarjo - Jakarta | 18.30 |
| 125F | Senja Utama Cirebon | Cirebon - Jakarta | 15.10 |
| 126F | Senja Utama Cirebon | Jakarta - Cirebon | 05.45 |
| 127F | Sidomutki | Solo - Yogya | 11.02 |
| 128F | Sidomukti | Yogya - Solo | 12.48 |
| 141 | Majapahit | Malang - Jakarta | 18.30 |
| 142 | Majapahit | Jakarta - Malang | 18.15 |
| 146-143 | Jayabaya | Malang - Jakarta | 11.45 |
| 144-145 | Jayabaya | Jakarta - Malang | 13.00 |
| 147 | Jaka Tingkir | Solo - Jakarta | 18.00 |
| 148 | Jaka Tingkir | Jakarta - Solo | 12.00 |
| 149 | Menoreh | Semarang - Jakarta | 08.00 |
| 150 | Menoreh | Jakarta - Semarang | 20.30 |
| 151 | Bogowonto | Yogyakarta - Jakarta | 09.00 |
| 152 | Bogowonto | Jakarta - Yogyakarta | 21.45 |
| 153 | Gajahwong | Yogyakarta - Jakarta | 18.00 |
| 154 | Gajahwong | Jakarta - Yogyakarta | 06.45 |
| 155-158 | Krakatau | Blitar - Merak | 06.40 |
| 157-156 | Krakatau | Merak - Blitar | 08.30 |
| 159 | Joglokerto | Solo - Purwokerto | 06.00 |
| 160 | Joglokerto | Purwokerto - Solo | 10.40 |
| 161 | Ambarawa | Surabaya - Semarang | 12.45 |
| 162 | Ambarawa | Semarang -Surabaya | 07.00 |
| 171 | Matarmaja | Malang - Jakarta | 17.30 |
| 172 | Matarmaja | Jakarta - Malang | 15.15 |
| 173 | Gaya Baru Malam | Surabaya - Jakarta | 12.00 |
| 174 | Gaya Baru Malam | Jakarta - Surabaya | 10.15 |
| 175 | Brantas | Blitar - Jakarta | 12.50 |
| 176 | Brantas | Jakarta - Blitar | 17.00 |
| 177 | Kertajaya | Surabaya - Jakarta | 21.00 |
| 178 | Kertajaya | Jakarta -Surabaya | 14.00 |
| 179 | Pasundan | Surabaya - Bandung | 08.10 |
| 180 | Pasundan | Bandung -Surabaya | 05.35 |
| 181 | Kahuripan | Blitar - Bandung | 12.10 |
| 182 | Kahuripan | Bandung - Blitar | 18.10 |
| 183 | Bengawan | Solo - Jakarta | 14.30 |
| 184 | Bengawan | Jakarta -Solo | 11.20 |
| 185 | Progo | Yogyakarta - Jakarta | 14.45 |
| 186 | Progo | Jakarta - Yogyakarta | 22.20 |
| 190-187 | Logawa | Jember - Purwokerto | 06.00 |
| 188-189 | Logawa | Purwokerto -Jember | 05.30 |
| 191 | Kutojaya Utara | Kutoarjo - Jakarta | 17.00 |
| 192 | Kutojaya Utara | Jakarta - Kutoarjo | 05.25 |
| 194-195 | Sritanjung | Yogyakarta - Banyuwangi | 07.00 |
| 196-193 | Sritanjung | Banyuwangi - Yogyakarta | 06.30 |
| 201 | Tawang Jaya | Semarang - Jakarta | 13.15 |
| 202 | Tawang Jaya | Jakarta - Semarang | 23.00 |
| 203 | Kutojaya Selatan | Kutoarjo - Bandung | 09.20 |
| 204 | Kutojaya Selatan | Bandung -Kutoarjo | 21.00 |
| 206-207 | Tawang Alun | Banyuwangi - Malang | 05.00 |
| 208-205 | Tawang Alun | Malang - Banyuwangi | 15.50 |
| 209 | Tegal Ekspres | Tegal - Jakarta | 13.50 |
| 210 | Tegal Ekspres | Jakarta - Tegal | 07.35 |
| 211 | Maharani | Surabaya - Semarang | 06.00 |
| 212 | Maharani | Semarang - Surabaya | 11.40 |
| 213 | Probowangi | Surabaya - Banyuwangi | 04.25 |
| 214 | Probowangi | Banyuwangi - Surabaya | 13.50 |
| 218-215 | Serayu Pagi | Purwokerto - Jakarta | 06.30 |
| 216-217 | Serayu Pagi | Jakarta - Purwokerto | 09.15 |
| 222-219 | Serayu Malam | Purwokerto - Jakarta | 16.30 |
| 220-221 | Serayu Malam | Jakarta - Purwokerto | 21.00 |
| 223-226 | Kamandaka | Purwokerto - Semarang | 05.00 |
| 225-224 | Kamandaka | Semarang - Purwokerto | 05.00 |
| 227-230 | Kamandaka | Purwokerto - Semarang | 10.25 |
| 229-228 | Kamandaka | Semarang - Purwokerto | 11.00 |
| 231-234 | Kamandaka | Purwokerto - Semarang | 17.15 |
| 233-232 | Kamandaka | Semarang - Purwokerto | 17.00 |
Pemesanan tiket dilayani di loket stasiun pada jam 09.00-16.00, mini market, telpon 121. Atau bisa juga beli lewat aplikasi Traveloka, Tokpedia, serta beli lewat situs Tiket,com.